Situata vicino al Tropico del Cancro, dove il Mar Rosso incontra il Sahara, Marsa Alam è ricca di palmeti e mangrovie, con un mare ricco di pesci per la presenza di barriere coralline.
Quest’ultimo è ben noto tra i subacquei per i numerosi siti di immersione incontaminati dove sono facili da trovare delfini, dugonghi e martelli.
La città ha un clima caldo e desertico con temperature più stabili che in luoghi più a nord come Hurghada e Sharm el-Sheikh, o comunque Kosseir, che tende ad avere un clima stabile ma con estati più fredde. Marsa Alam, Kosseir e Sharm el-Sheikh hanno temperature notturne più calde rispetto ad altre città egiziane e resort vicino alle località.